《数码宝贝驯兽师之王:冒险者的战斗》在网络世界中,奥米加兽与梅菲斯兽交手。奥米加兽指出梅菲斯兽意欲危害社会,要置它于死地,却不慎被它逃到现实世界。现实世界里,启人暑假为了代替父母扫墓来到冲绳,与表兄弟阿海救下了一个被数码兽追赶的少女美波。这些数码兽,似乎想要抢夺少女所带的笔记本电脑。备受欢迎的电子宠物V-Pet背后,到底隐藏着什么阴谋?为保护美波而诞生的石狮兽,究竟有何不同寻常之处?